基于机器学习的生物医学信号处理

历史匿名回执 · 2022/06/21

课程内容：难，机器学习深度学习全家桶往里灌，模型多到像过年超市促销买一送十。 上课自由度：高 考核标准：10%课堂参与+40%作业+50%final project（30%报告+20%视频pre） 讲课质量：一般。上课讲的东西基本没用，属于那种听完感觉自己被知识路过了一下。 第二节课老师亲口说这门课主要针对大二致远生科or化学的学生，然而这批人概率统计可能刚学或者没学，编程更是一片空白。然后前五周的作业全是统计，老师课上讲不清楚，课后你得自己花大量时间自学，翻译一下：交学费买了个自学营门票。 到了第六周，进入机器学习，涉及支持向量机、交叉验证、深度学习、多模态学习和图神经网络。基本上一周讲一个模型（深度学习讲了两周），每周小作业是实现一种模型，然后写一个2-3页的report（ieee双栏模板，10号字）（注意是每周一个模型和一篇report）。这不是上课，这是每周被布置一篇论文版周记。助教说图神经网络太复杂了，就不用实现了，于是作业变成读两篇ICRL和NIPS上的论文然后总结思路，好家伙，从写代码变成写读后感。老师上课基本就是概论课，和作业关系不大，ppt也缺乏重点（部分是照抄西瓜书）。每节课最后有实践课，助教会简单讲一下作业实现相关的代码，基本上也是给网上的教程，应该算是这门课唯一有用的部分了，相当于一整门课里唯一没掺水的那个小时。 最后三周进入组学部分。上课内容另一个回答说了，然后十五周会发两篇nature和cell上的论文，每个人负责一段，十六周pre，按照老师的说法，不管有没有生物背景，看的都很难受。翻译：大家一起坐牢，只是牢房装修风格不同。 期末大作业是利用TCGA-LUAD数据集分类，数据集另一个回答也说了。大作业给分标准挺迷的，我劝选课的同学别想着卷模型了，不看这个的，多写点生物相关的，老师爱看，模型卷成花也没用，不如开始文学创作。 总结一下，这门课除了计算机的同学，生物的or非生物的学的都很难受（我感觉是这样），中期直接退了一半，这退课率像极了恐怖片里第一批领盒饭的群演。这门课基本默认你有python和numpy/pandas基础，大概率也是有机器学习基础的，毕竟梯度下降他就讲了两分钟，两分钟，泡面都还没软。卷积神经网络和pytorch你最好也懂一点，因为作业要实现。然后原理你就不要想搞懂了，看ppt不如啃西瓜书。 如果对自己的自学能力很有自信，推荐你来，上完这门课你的代码能力会得到质的提升（90%是你自学的功劳）。反正我这学期至少40%的时间都花在这门课上了，结果最后就拿了这点分，挺好的，好得像被人拍了拍肩膀说年轻人要多吃苦。 （给选课的同学一点建议，上课基本上是听不懂的，前面的部分可以先看吴恩达的机器学习，卷积神经网络可以看李宏毅/李沐/cs231计算机视觉，b站上都有，有什么不懂的概念google一下，不会用的函数去查官方文档，这样你写作业会好受一点。千万不要想着搞懂，想搞懂你就输了，这课的正确打开方式是学会和不懂共存） （补充：最近又看了一下课件，能在两周时间讲完几乎深度学习所有主流模型及其变种和应用，包括CNN，FCN，RNN，Transformer，VAE，GAN，可想而知这门课能有多深入了，大概就是每种模型发一张证件照然后赶去下一个景点的程度）

历史匿名回执 · 2022/06/10

课程内容：量大管饱，属于是端上来一桌满汉全席但你没筷子。 上课自由度：自由到什么程度呢，本学期人就少，大概只有十来个人（二十多人选课，中期退课退了一大半，原因后面会说），加上疫情线上上课，所以基本课上随便做什么（然后就划水了。。。，一节课没听，看ppt+google），没有签到——这自由度堪比放养，人在教室魂在峡谷。 考核标准：平时（50）+大作业（50），大作业最后一周布置，18周交，我觉得不太合理，期末还要准备考试。。。这是把你按在地上让你用最后一周跑完马拉松还顺便背单词。 讲课质量：延续了致远一贯的风格，多个老师上课，负责不同的part，大概分为 生物统计（张岳老师）：张岳老师讲的还是比较细致的，但是感觉他讲的不清楚，课上的实践部分没有好好利用，所以课后需要再自学一遍——细致是细致，就是细致地把你说困了还是没懂。 深度学习部分（戴文睿老师）：戴文睿老师负责了讲深度学习部分，基本都是介绍性的，ppt里会有推导部分，上课推导部分一般都是一带而过，每节课最后会有助教进行实践展示，比如教怎么搭建神经网络，怎么写SMO......(实践课部分还是不错的)——推导像高铁过站，助教实践环节倒像是全场唯一给你上菜的服务员。 组学部分（李靖老师）：李靖老师一共负责三节课，第一节课讲了基本生物学知识（这部分就几乎不用听，高中生物知识），第二节课讲了组学数据处理的一些方式，助教有实践展示，第三节课文献阅读（大概就是16周发一篇六十多页的cell要求学生进行文献阅读，然后一堆读不懂，课上pre的那种。。。）——16周空投一篇六十多页的cell，读不懂还要上去pre，属于是让新兵直接空降诺曼底。 总体而言：讲课质量不咋地，但是每节课都有作业，还有期末大作业（期末大作业的数据集近600G），门槛不低（第一节课，张岳老师布置了十道生物统计的题目，一写写几天。这也是二十多人选课，中期退课退了一大半的原因）——600G数据集往那一摆，选课系统都替你想好了退路。 给分：期末成绩暂且无，平时成绩看作业分，张岳老师的助教给分很严格，以计算题的形式，结果错了一整题都没分（大概班级均分6-7分），戴文睿老师的助教给分很宽容，以实验+报告的形式（属于是两个极端了）——一个助教拿显微镜扣分，一个助教拿麻袋发分，你选课等于开盲盒。 意见：建议认真写作业，写作业还是能学到东西的，至于听课，看个人需求。建议有一定的基础的并且愿意每周花时间写作业的来选，否则就大概率退课了——想混就别来，想学就来，中间地带的人基本都在中期退课大军里找到了自己的归宿。