生物信息学(C类) · 修读回执档案

天问级别的史诗悬案：陈海峰到底会不会生信？这问题从人类基因组计划问到了今天。

救命，这课的质量是怎么炼成的？pre和project堆成山，课上又是半个字不教，期末还整一套谜之怪题，老师自己讲都讲不明白，然后随手抛几道题把我们当场验货，给分还惨不忍睹，避雷

课程内容：剔掉生信goat吴老师那部分，剩下的就是一坨 上课自由度：无，全勤点名永动机 考核标准：考试60%，生物新概念pre+ai蛋白设计project才15%，签到+作业+小测才10%，goat吴老师的上机课15%（第16周的上机作业还取消了，呜呜呜，**吴老师真好**） 授课质量： 1. 讲课烂得抽象，上课ppt就是**近20年前风干的一坨陈年老翔**，还能自己前后吵架，讲信息差时前面定义用减号，后面例题原地变异成加号，chf就这么一脸平静地滑过去了，纯照ppt念经，口癖还严重，满嘴“的说”“的说”“的说”无限循环，关键信息根本抠不出来。 2. 小测抽象得离谱，贪婪算法我看chf本人也没整明白，前后两个版本原地鬼畜横跳，那我小测的分上哪哭去啊喂。 3. pre精准占领考试周前整整一个半天的空窗，策划脑回路堪称艺术，这么想让学生上台讲，你自己少讲点不行吗。 4. project像老师让助教拉了一泡，然后非逼你在考试周把这泡搓成粪球，再拿这颗粪球跟文献比对亮点，写完还得acknowledgement致谢老师和助教，我谢你个得er，没见过这么抽象的project。助教甚至能把给的蛋白标错，5TPN写成5TRV也是绝世神人，还把5TRV的结构和功能位点信誓旦旦挂ppt上，助教真的见过5TPN长啥样吗？ 5. 考试里**一道看图数数这种幼儿园级别的题都能错**，好在考试时我对chf已经形成了清楚的认知，默认他是出错了，然后反推他怎么错的再挑答案（ 6. 上到一半作业突然人间蒸发，最后发现是助教忘布置了，所以15周直接一波**动漫级的作业量**糊脸。 *** 总结： 能把一门课每个零件都做成这样，说明陈老师还是有点硬实力的。 众所周知，DLC质量往往吊打本体，要不是这几节上机课，我是真的一点东西都学不到，这课不如直接打包给wmy登基。 *** **补：盐豆不带盐的，破事一堆，平时分乱甩，作业基本全满分，三次上机课两次99，一次98，上课全签到，难道就因为瞎改的小测和project、pre就直接扣到80分，头回见用平时分把考试分按地上摩擦的鬼物，大部分人被助教用平时分狠狠卡住绩点，简直是交大金课里的金课**

**声明：除非特别说明，以下所有点评仅针对chf，与吴老师无关。** 课程内容： 两两比对，多序列比对，序列组装，生物数据库，搜库算法，核酸序列识别，系统发育分析，蛋白质结构预测；吴老爷讲4节lab课：数据库获取、比对算法、系统发育、组装算法。 上课自由度： 低。所有人需要在座位上放助教准备的名牌，跟出席某种国际峰会似的，老师上课时也会经常突然停顿问你听懂没有（不过一般不是提问，是心理战） 考核标准： 蛋白质设计项目+文献分享 = 15%， 过程考核（目测为：签到+课堂小测+课后作业） = 10% （没错就是两三部分加一起15%，也没分清哪块是几分，跟Excel抽奖差不多） 上机 (wmy) 15% 考试 = 60% 题型：单选+多选+判断+名词解释+计算题 授课质量： 这门课能拿到现在这分，就在于你每开一个新作业或新项目，都能跟一大坨槽点撞个满怀。 1. chf的PPT绝对是集了所有常犯错误的反面教材：字体不统一、排版靠缘分、默认图案背景用得飞起、同一行还要分几个文本框蜗居、右下莫名的指南针一直转。就这甚至还是有原型参考的：东南大学的生信PPT是清朝风但至少思路清晰，你连格式都懒得换翻成英文就直接端上来，中文塞备注里。考试又只考中文，那请问你这样**破坏原版的意义何在？** 2. 评分标准混乱。上课讲贪婪算法要求把没并入超串的子序列写在结尾，小测助教改分允许不写，结果老师又按照课上讲的那样重改（先不聊贪婪算法本身规定）。考前讲作业又回到助教那套标准，一直到上了考场你还在“**揣摩出题人的意图”**。 3. 上机课内容和大作业严重离婚，受人以colab，考人以RFdiffusion ProteinMPNN Alphafold2。课件上的PDB编号和结构都是错的，把5TPN写成5TRV，研究了半天发现不对，一问助教还真是，脑子里已经浮现出那种一拍脑袋想出来的**选题，完全没过可行性这一关**。 4. 从07年生信开课到现在的课件，简直像时间胶囊，除了最后加了个蛋白质三级结构，其他几乎没变过。考题也是在往年原题上洒点时事热点，比如24年跟af3的风，考一堆人工智能机器学习Alphafold3，实际上这些名词解释根本没完整在课件里出现过。偶尔**改两道原题选项还能改错**。 生信班的同学是铁了心要啃这口托达芬了，强烈建议强基能撤就撤，上课在“就是说”循环播放和突然被点名关心你的催眠与失眠之间反复横跳，PPT完全就是精神污染，偶尔能听的几节lab课还附赠蛋白质设计全流程豪华礼包。人家生统课程都改革了，你从06年苟活到现在能逃过一劫就觉得自己稳了？***教务不撤生信C，生信万古如长夜！*** **二编**：平时分清一色的80，隔壁冯老师的生化至少不拿考试分高去压平时分。这脸是真不要了。

课程内容：生物信息学 上课自由度：一般，会有打印的名字，像外卖单一样贴在那儿等你认领 考核标准：考试/大作业 授课质量：一般吧，上课喜欢轮着问一遍xxx有什么问题吗（），问得全班像在参加击鼓传花，每个人都祈祷别停在自己这 感觉其他问题都被说了，但是我只想知道我上课作业一次不落为什么平时分只有80枉费我期末周咬牙把弱智大作业熬完，熬完那一刻感觉自己像被系统判定为氛围组

课程内容：生物信息学的基本理论知识，上机前半部分是复现一篇文章（3D-QSAR，分子对接和分子动力学模拟），后半部分是对理论部分的实践部分（数据库，序列比对，基因组拼接，进化树） 上课自由度：线下会发名牌摆在面前…有点小离谱，这是什么，认亲大会吗，签到签到，签到最后签出个社死仪式感 考核标准：平时作业+lab课project（40%），考试（60%），数字就长这样，别问了，问就是命运的分割线 授课质量：怎么说呢…理论课和上机课都很抽象，听也听不懂，每节课都在赶鸭子上架啊啊啊啊，鸭子本人表示也没这么赶过 期末考试试卷上甚至有个大题，题干都是病句，根本不知道要算什么，出题人是不是和语文老师有仇 PPT的逻辑也蛮感人的，复习的时候根本看不出来什么是真的重点，主打一个你猜你猜你猜猜猜 考完之后再去赶上机的project，真的做得头痛，电脑都快被各种文件塞爆了，各种名字的处理文件、各种软件，桌面乱得像案发现场，最后10ns的MD模拟居然跑了一晚上🙄，电脑风扇转得比我心跳还快 Journal Club的选题也蛮离谱的，好在只用讲5分钟左右，问题基本由老师提，相对而言还算轻松的，属于离谱里夹着一丝慈悲 **交叉的同学不要选不要选不要选！** 但是之所以打4分，是因为如果是必修课，只能说积极面对吧（唉）。希望不要看了我们的评价之后，一开始就对这门课抱太大的负面情绪，毕竟最后再烦躁也得上考场。助教平时分给的很仁慈，期末加油复习，相信你们！

课程内容：这门课就像有人把一整个硬盘的模型和概念直接格式化进我脑子里，3年至今没缓过来原来是我CPU烧了。8点线上考试，之前明明好好复习过了，当天5点起床跟背单词似的狂背，结果选择填空背到的一个没考，没背的全考了，哈哈（哭）。PPT巨丑无比，内容逻辑你说它有关联吧又好像没有，老师讲课像在念安眠药说明书，三年以来最差的课没有之一。 上课自由度： 考核标准：这些都有人反馈过了，我就不多说了，在这嚎一嗓子纯属是往伤口上撒盐，奉劝各位非必选就踹开这门课，快跑。 授课质量：

- 课程内容：生物信息学的算法，听起来像要去开宗立派，实际是给你发把扫帚去扫天书。 - 上课自由度：低的一批（必须得来，每个人钉在姓名牌上像幼儿园挂胸牌，课前随机点人提问、课堂随机点人问题、经常一堆小测考试，突袭频率比外卖满减还勤。 - 考核标准：平时每周作业+课堂签到+lab+期末+上机大论文+课堂个人展示（挑一堆新名词比如人工智能机器学习随机分人讲——好家伙，抽签抽到人工智能，我连人是不是工智能都没搞明白）+课堂小测+lab（**最后四次的lab爆炸多多多多多多！！！！！而且赶上期末！等于你本就抱着炸药包冲刺，还要在终点线前多扛八个铅球，如果是大四或者有很大的其他课压力那就是噩梦！！！！！**） - 平时分40分，期末60分（你平时事情这么多，要是平时分给60我还能接受，但现在是40，这买卖干得比滴滴司机还黑。 - 授课质量：外专业的别来选这个课就是了，低质感还吃时间。lab跟上课讲的，一个在东三环，一个在西五环，相距恕不奉陪。如果是生信的，那就没办法了，火坑内循环。 - chf的PPT是我在交大所有课里面见过**最丑的ppt，没有之一**，格式内容一塔糊涂，目录长得像捉迷藏冠军，第一点来了，后面直接人间蒸发。（有楼友说这是抄的东南大学生物信息课件，我还真去搜了，好家伙，真就是Ctrl+C→Ctrl+给灵魂换台，文字扒下来换个巨丑无比的模板（纯背景蓝色纹理的ppt默认模板，审美还在2003年），人家东南大学原版都比你这个顺眼，起码人家一张幻灯片有个title，123点能看到脖子，你这个PPT我是打开就想给屏幕做心肺复苏。甚至怀疑期末题目是不是也是这套流水线，但试卷下载不了查无实锤，感兴趣的可以自行观摩：http://bioinfo.seu.edu.cn/xxpt/lecture.html - 不管是局部还是整体，都挺差的，内容像被猫挠过的毛线球，一会这个一会那个，Lab也设计的烂的一批，真·随机播放，想起什么讲什么。 - 最后几周的lab是吴茂英讲的，狂塞一堆东西，上课讲不完直接开摆，大家自学吧，课件在那，缘分也在那。 - **交叉选进来的、外专业的选进来的都快跑！！！后面的作业一堆，还有个人的pre，这不是上课，这是许愿池里捞铁饼。** 我就好奇现在除了程序设计课，还有啥专业专门给自己安排一堆上机课的（就程序那种基础课的上机，会的都不用去或者三分钟写完作业，当时无聊我甚至拿机房电脑装了原神），这课上机完全就是跟幼儿园一样教你一步一步点按钮，原理一个字不提，像在训练机械臂，还要求你做毕业设计规模的大作业，甚至TM离谱到家的是：必须Windows7的电脑才能做，都2023（不，评论只说了'都什么年代了'，但这个年代感已突破大气层）。。。 服了，班里一群人反馈Lab各种做不了，还在那比谁更头铁，稍微懂点事的就知道该取消或者换大作业。自己心里没有B Tree、助教讲的什么玩意儿自己真的会吗，还搞个什么破Pre，真以为人人都是从云里长大的，精通云计算、机器学习、还有rosetta（我tm第一眼还以为你说的是macOS那个转译层），一堆新鲜名词标签往课桌上一贴就完事，作业垃圾（还他妈专门拖到最后赶着考试周前做Pre，嫌大家死的姿势不够优美）。难怪生化环材四大天坑，学不到东西，成天在百度copy做Pre，或者背那些名词解释当经文，要不就是逮着AI、人工智能各种标签给自己脸上扑粉，课上得一跳一跳的，今天讲这明天讲那，讲不完啪，作业甩出来你们自学，跟正课关系？基本等于迪丽热巴和我的关系。这课怎么开的我都怀疑人生，要说真学到东西了，那真是活见鬼。 拿个win7年代的狗屁软件让人给你对接，对个狗屎的街，连CTRL+Z都没有，好像在教你用石斧编辑4K视频，按钮反人类，画个分子能气得你把鼠标甩出去，生物科研就这样？科研大佬就用这种神仙工具，还得给电脑开时光机回win7？工具都收拾不利索还科研。 学弟学妹自求多福，生科就那样，课就是复现高中那一套（往死里背，仿佛蓝色生死恋番外版），生信也没好到哪儿，往死里卷，不信来试，真的就是把生命泡在一些没有多大意义的事情上无限加时长。低年级能跑的快跑，想转的快转，到了后头想润基本是日暮途穷。要么今后一世耗在生物里，要么找个不读大学也能干的工作（说白了你的大学读了个寂寞自由泳）？至于想润，难死。生信勉强说还有一咪咪薄弱的代码底子（少数人除外，而且人家代码水平绝对不是生信课教出来的，也不是跟着科研改编模型练出来的，**更不是靠百度搜关键词搜出来的（这句是因为看到了水源的帖子作为注脚的有感而发：[水源链接](https://shuiyuan.sjtu.edu.cn/t/topic/80315/43) ）**）生工生技那还是算了，对润基本0加成。 - 代码水平锻炼不了，拿交大的低质量数量级的数据结构和计算机网络硬往生物信息里面的信息两个字上怼，美其名曰我们有CS课。 - 实际成天在纸上画图推导做算法，或者拿个R在那儿对着网课照葫芦画瓢生成几张画，就这也好意思叫代码、叫信息？那我打开表情包也是信息时代。 - 课表塞满上机课，学生抱着笔记本呼哧呼哧往叶楼跑，机房电脑2/3开不了机，这叫上机？这叫生物信息试点班？试点摊煎饼失败了是吧。 - 当然，如果切实课程质量都很高，把大伙代码水平都磨得很硬，那就真没人留生科/生信了，毕业集合完毕光速润。 然后又来忽悠没学到东西的人：“那是因为你没加实验室，做科研光靠上课远远不够”，好一手拿科研PUA。对于这种话术只能说：课本身就那啥，都是垃圾课让人咋学？唯一还算勉强摸到“不错”二字的就吴老了。结果吴老爷也比较懒，到了14个周脑门一拍想起要整后端开发，然后告诉你延期到18周交个web app开发的东西出来，**实际上教了半节课不到就下课了，然后就没有后文了**。（我欲言又止，他负责数据库宇宙大理论播报，你负责写web app，相看两不认。）有的专业高质量读下来简历项目能列一页，还不见得是科研实习的水货，至于生科，简历…嗯，可能主要是奖学金、学生会以及科研实习三件套吧，半页都悬。 **扯远了，但还想说，若在来交大前能查一遍课的质量，如果交大能取消提前批不能跨平台转专业的这破政策，也许不少人的命盘会重开。选个好点的专业，选个专业课质量顶用的专业，还能图以后有口饭吃。填志愿别只看那些XXX学校XX专业NB/A/A+的彩虹理论，决定你以后有不有饭吃的是专业课是地基，科研是外挂，能力是处理器，至于名校排名，那是TA家的，不是你的。地基已经像三和老哥的积木，还硬要拿科研亡羊补牢，叫本末倒置，地基晃晃装吊顶，塌下来第一个压你怀里** --- **课程试卷已上传，造福下一届吧： [试卷链接](https://share.dyweb.sjtu.cn/course/17721)** （浅评一下考试，经典名词解释选择题单选题多选题配方，估摸每年题目也都是那些，选择题就硬背——背到了撞上大运，非选择题基本小测做过就能治，照葫芦画瓢。但你考这些选择题到底是要招谁啊，卷积神经网络，上来就这么豪横，我连机器都修不明白。你要复习那就好好教机器学习算了（我猜你也教不出来），把我当成一个背诵机器开关，捧着那些方法的破题一顿狂背，脑内CPU已经着火） ---- （总之这课打1分是毋庸置疑的，能别选的别选，必修的靠试卷复习保命，最后一节课划的重点多少还有点用，能给的棺材挪一挪就这些）最后留一个问句：上大学开始至今，那些自科班或者生物信息的专业课试卷，我相信基本都有一个通病——魔力值堆蓝量堆背诵能力，有人节节课盘笔记，有人突击一晚上拿到满盏明月灯（满绩），等到课下架之后你还记住多少？而这，真的是让你想要的大学生活吗？

课程内容：生物信息学 上课自由度：高（助教会把所有同学的姓名牌打印出来，上课得把自己的那块摆桌上当认领） 考核标准：作业+小测+lab+期末（60%） 讲课质量：复习复习着人就复习到暴躁了，来此宣泄一下。个人认为这门课的设置本身就挺拧巴。陈老师讲的内容基本就是东南大学生信实验室的那套课件（好像ppt也一样），但内容偏老，有些知识点长得一脸问号，网上搜也搜不到靠谱解释（比如Smith-Waterman算法讲得跟公认版本压根不是一个物种）；相形之下吴老师那四次实验内容上新鲜点，但那玩意儿狂往里塞，导致lab做起来苦不堪言。这学期还有交叉课程选过来的，估计他们也是被按在地上摩擦。再者两个老师各讲各的王，连接基本靠气，比如陈老师讲assembly算法讲的是OLC，吴老师讲的是DBG，对它们为什么存在、适用什么条件又完全没解释，搞得我一度怀疑为啥同一个内容要塞俩割裂版本进去。另外前三次lab是CADD的内容，原理几乎不讲，就是助教操作我们对着抄，既无聊又学不到东西。想交叉同样内容的话，建议直接去选生医工的生信课。 --------------- 人家BME的《生物医学信息学》2学分的课，dp和HMM也都能细讲，连重要的测序方法都覆盖了，还有围绕测序分析的一大波算法，外加手把手的实际数据分析。这门课除了wmy几个lab稍微潦草提了下NGS，其他都在硬讲老掉牙的东西，有些甚至在灌输错的。生信系的老师要不要琢磨琢磨人家的课是咋搭起来的？